طبقًا للأمر رقم 70-87 المؤرخ في 15 ديسمبر 1970، والمرسوم التنفيذي رقم 08-214 المؤرخ في 14 يوليو 2008، ووفقًا للمواد 19 و20 و21 من المرسوم التنفيذي رقم 16-176 المؤرخ في 14 يونيو 2016 الذي يحدد النظام الأساسي النموذجي للمدرسة العليا، تتمثل مهام المدرسة فيما يلي:
ضمان التكوين في العلوم البيطرية؛
ضمان التكوين العالي، والبحث العلمي، والتطوير التكنولوجي في مختلف تخصصات العلوم البيطرية؛
ضمان تكوين إطارات سامية متخصصة في العلوم البيطرية؛
التكفل بالاستشارات الطبية وإنجاز الدراسات البيولوجية المتخصصة ذات الصلة بالقطاعات المعنية بهذا المجال؛
إنجاز أعمال البحث في التخصصات التي تدخل ضمن مجالات التعليم التي تؤمنها المدرسة؛
تلقين الطلبة مناهج البحث وضمان التكوين عن طريق البحث ولأجل البحث؛
إدماج بُعد الابتكار، ونقل التكنولوجيا، وريادة الأعمال سواء في التكوين أو في البحث؛
المساهمة في إنتاج المعرفة ونشرها، واكتسابها وتطويرها؛
تحسيس الطلبة وتشجيعهم على الابتكار وريادة الأعمال.
وفي مجال البحث العلمي والتطوير التكنولوجي، تضطلع المدرسة بمهمة أساسية في مجال أو مجالات اختصاصها، تتمثل فيما يلي:
المساهمة في الجهد الوطني للبحث العلمي والتطوير التكنولوجي؛
ترقية وتطوير العلوم والتقنيات؛
المساهمة في تعزيز القدرات التقنية الوطنية؛
الإسهام في تطوير البحثين الأساسي والتطبيقي داخل المؤسسات الوطنية العمومية والخاصة، من خلال تشجيع الابتكار؛
المساهمة في تثمين نتائج البحث العلمي ونشر المعلومات العلمية والتقنية؛
المشاركة ضمن المجتمع العلمي الدولي في تبادل المعارف وإثرائها؛
ترقية الإنتاج العلمي وتشجيع روح التنافس العلمي.